ШАРТЛИ БЕЛГИЛАР РЎЙХАТИ 6
КИРИШ 10
1-БОБ. HELICOBACTER PYLORI БАКТЕРИЯСИ ҲАҚИДА УМУМИЙ
МАЪЛУМОТ 17
1.1.§. Helicobacter pylori бактериясининг ўрганилиш тарихи 19
1.2.§. Helicobacter pylori бактериясининг биологияси 21
1.3. §. Helicobacter pylori бактерияси инфекциясининг тарқалиши. 24
1.4.§.Helicobacter pylori бактериясининг патогенлик хусусиятлари. 28
1.5.§. Helicobacter pylori генетикаси 32
1.5.1.§. Helicobacter pylori VacA гени тузилиши ва функцияси 34
1.5.2.§. Helicobacter pylori CagA гени тузилиши ва функцияси 42
1.5.3.§. Helicobacter pylori IceA генининг тузилиши ва
функцияси 47
2-БОБ. HELICOBACTER PYLORI БАКТЕРИЯСИНИ
ИДЕНТИИКАЦИЯЛАШДА ҚЎЛЛАНИЛГАН ЗАМОНАВИЙ
УСУЛЛАРИ 49
2.1.§.Тадқиқот материаллари 49
2.2. §. Тадқиқот усллари 50
2.2.1.§. ДНК ни ажратиш усуллари 51
2.2.2.§. ДНК концентрацияси ва тозалигини ўлчаш усули 51
2.2.3.§. Полимераза занжир реакцияси (ПЗР) усули 52
2.2.4.§. Гель-электрофорез усули 54
2.2.5.§. Айни вақтдаги ПЗР (Real-Time PCR) усули 54
2.2.6.§. ПЗР маҳсулотини тозалаш ва унинг
концентрациясини флуорометрия усулида ўлчаш 55
2.2.7.§. VacA генини секвенс қилиш учун праймерлар
дизайни 56
2.2.8.§. VacA генининг секвенс реакциясини ўтказиш ва 574
севенс маҳсулотини тозалаш
2.3.§. Секвенс натижаларни биоинформатик дастурларда таҳлил
қилиш ва маълумотлар базаси билан таққослаш усуллари 58
2.4.§. Олинган натижаларни статистик тахлили 59
2.4.1.§. Эҳтимоллар нисбати ва нисбий ҳавфни аниқлаш 59
2.4.2.§. Ташҳислаш самарадорлигини аниқлаш 61
3-БОБ. HELICOBACTER PYLORI БАКТЕРИЯСИНИ ВИРУЛЕНТ
ГЕНЛАРИ БЎЙИЧА ГЕНОТИПЛАШ ВА ОШҚОЗОН-ИЧАК
КАСАЛЛИКЛАР БИЛАН БОҒЛИҚЛИГИНИ АНИҚЛАШ 62
3.1.§. Helicobacter pylori бактерияси вирулент CagA, VacA, IceA
генларини учраш частотаси 62
3.2.§. Helicobacter pylori бактерияси вирулент CagA, VacA, IceA
генларининг касалликлар билан ассоциацияси 69
3.2.1.§. Ошқозон саратони билан CagA, VacA, IceA
генларининг ассоциацияси 73
3.2.2.§. Гастрит билан CagA, VacA, IceA генларининг
ассоциацияси 74
3.2.3.§. Ошқозон ва ўн икки бармоқли ичак яраси билан
CagA, VacA, IceA генларининг ассоциацияси 75
3.2.4.§. Ярали колит билан CagA, VacA, IceA генларининг
ассоциацияси 77
3.3.§. Гастроэнетерологик касалликларда H.pylori патоген
изолятларини аниқлаш учун ПЗР усулларини такомиллаштириш 83
3.3.1.§. Real-Time PCR методи ёрдамида CagA генини
идентификация қилиш 83
3.3.2.§. Мультиплекс ПЗР методи ёрдамида CagA гени ва
VacA генининг s, m типларини аниқлаш 85
4-БОБ. МАҲАЛЛИЙ H.PYLORI БАКТЕРИЯСИ ИЗОЛЯТЛАРИНИ
VacA ГЕНИ НУКЛЕОТИТЛАР КЕТМА–КЕТЛИГИ ВА УНИНГ
ҚИЁСИЙ ТАҲЛИЛЛАРИ 895
4.1.§. H.pylori бактерияси VacA генининг нуклетидлар кетмакетлиги 89
4.1.1.§. VacA гени s-регионининг нуклеотидлар кетмакетлиги 90
4.1.2.§. VacA гени m-регионининг нуклеотидлар кетмакетлиги 93
4.1.3.§. VacA генини p33 ва р55 регионларининг
нуклеотидлар кетма- кетлиги 95
4.2.§. H.pylori бактерияси изолятларининг VacA гени бўйича
филогенияси 99
4.3.§. H.pylori бактерияси изолятларидаги VacA оқсилининг
қиёсий таҳлили 100
ХОТИМА 111
ХУЛОСАЛАР 116
ФОЙДАЛАНИЛГАН АДАБИЁТЛАР РЎЙХАТИ 117
ИЛОВАЛАР 151
